BioBooks
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第一章 生物信息学习资料
第二章 生物信息常用工具
第三章 在线工具
第四章 Linux基本操作
第五章 生物软件
第六章 生物数据库
第七章 测序原理
第八章 python
第九章 R语言
9.1 R语言简介
9.2 R分析环境搭建
9.3 免费R分析环境
9.4 开始使用R
9.5 函数
9.6 常用快捷键以及自定义环境
9.7 R语言包管理
9.8 安装R包
9.9 Bioconductor
9.10 文件操作
9.11 R读写文件
9.12 数据结构
9.13 向量
9.14 矩阵
第十章 基因组拼接
第十一章 基因组数据分析
第十二章 宏基因组数据分析
第十三章 16S数据分析
第十四章 RNAseq数据分析
第十五章 单细胞数据分析
第十六章 纳米孔测序数据分析
BioBooks
第九章 R语言
在 GitHub 上编辑
第九章 R语言
markdown
9.1 R语言简介
R语言简介
R语言应用
R语言优缺点
R语言的缺点
R语言与Excel对比
R语言与Python对比
9.2 R分析环境搭建
R软件安装
Rstudio软件安装
登录rstudio-server
9.3 免费R分析环境
9.4 开始使用R
设置工作目录
创建Project
交互式运行
脚本式运行
RMarkdown文本
9.5 函数
R语言函数
4.2游戏:测试计算机算力
R语言括号
R语言提示警告以及错误
9.6 常用快捷键以及自定义环境
常用快捷键
自定义R环境
9.7 R语言包管理
1 如何选择合适的R包
2 R包的管理
9.8 安装R包
1 install.package()函数
2 R包管理函数
3安装指定版本R包
4 Github站点R包安装
5 查看帮助文档
6 R包迁移
9.9 Bioconductor
1 Bioconductor简介
3.2 Bioconductor分类
3常用工作流程
4 Bioconductor包的安装
9.10 文件操作
1 结构化数据与非结构化数据
2常用文件类型
3下载练习数据
4 Rstudio导入文件
9.11 R读写文件
1 读取csv文件
2 写入文件
3 读写excel文件
4 读入纸质版表格
5 其他R数据格式
9.12 数据结构
1数据类型
2常用数据结构
3内置数据集
9.13 向量
1 创建向量
2 向量索引
3 向量计算
9.14 矩阵
1 创建矩阵
2 矩阵索引
3 利用矩阵绘制热图
4 分组条形图