BioBooks
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第一章 生物信息学习资料
第二章 生物信息常用工具
第三章 在线工具
第四章 Linux基本操作
第五章 生物软件
第六章 生物数据库
第七章 测序原理
第八章 python
8.1 python语言简介
8.2 python分析环境搭建
8.3 使用vscode运行python
8.4 pycharm开发环境
8.5 python代码风格
8.6 变量
8.7 循环
8.8 判断
8.9 循环+判断案例
8.10 文件操作
8.11 读取文本文件
8.12 读取文件案例
8.13 选项参数
8.14 python程序框架
8.15 python模块管理
8.16 使用自己开发的模块
8.17 python数据结构
8.18 列表元组集合
8.19 字典
第九章 R语言
第十章 基因组拼接
第十一章 基因组数据分析
第十二章 宏基因组数据分析
第十三章 16S数据分析
第十四章 RNAseq数据分析
第十五章 单细胞数据分析
第十六章 纳米孔测序数据分析
BioBooks
第八章 python
在 GitHub 上编辑
第八章 python
markdown
8.1 python语言简介
python语言简介
python优点
python缺点
python生物信息编程应用
python两种运行方式
python开发环境
8.2 python分析环境搭建
Anaconda简介
为什么选择Anaconda?
安装Anaconda
8.3 使用vscode运行python
vscode简介
下载vscode
安装插件
vscode中运行python
vscode设置
vscode快捷键
8.4 pycharm开发环境
pycharm简介
下载安装pycharm
配置python解释器
安装插件
在pycharm中运行python
pycharm常用快捷键
8.5 python代码风格
PEP8
python代码注释
8.6 变量
什么是变量?
python下划线变量
python中点的作用
8.7 循环
for循环
批量生成脚本
while循环
for循环改成while循环
8.8 判断
if-else结构
if-elif-else结构
循环+判断
8.9 循环+判断案例
案例一:循环加判断
案例二:计算数字值
案例三:判断是否存在
8.10 文件操作
1 目录结构
8.11 读取文本文件
8.12 读取文件案例
1 求和计算100万个值
2 计算基因长度
3 读取压缩格式
4 写文件
5 过滤blast比对结果
6 fastq转换为fasta
7 开发流程
8.13 选项参数
1 sys.argv
2 argparse
8.14 python程序框架
8.15 python模块管理
1 python模块介绍
2 利用pip安装模块
3 利用conda管理模块
4 虚拟环境
5 模块路径
6 加载python模块
8.16 使用自己开发的模块
1 自定义函数
2 实参和形参
3 自定义函数箭头
4 main()函数
5 导入模块
8.17 python数据结构
1 标量
2 字符串
8.18 列表元组集合
1 创建列表元组和集合
2 求和计算
3 列表索引
4 操作列表
5元组
6 集合
8.19 字典
1 创建字典
2 字典属性与方法